FAZENDO O BACKUP : 

No sistema em que vai ser formatado ou antigo HD , encontre a pasta do usuário e entre na pasta appdata, a mesma fica oculta então temos que digitar manualmente como no exemplo abaixo : 

C:\USERS\FULANO\APPDATA\ROAMING 

Dentro da pasta Roaming do usuário tem a pasta THUNDERBIRD  copie ela inteira. 

RESTURANDO NA MAQUINA NOVA: 

Faça a instalação do thunderbird na maquina nova e deixei o mesmo fechado; 

Acesse a pasta Roaming do usuário conforme feito no passo do backup,e apague  a pasta do thunderbird; 

Agora copie a pasta copiada no computador antigo, depois de finalizar a copia , abra o programa.